Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI3P10071 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI3P10071 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI3P10071 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI3P10071 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI3P10071 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI3P10071 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI3P10071 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI3P10071 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI3P10071 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI3P10071 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI3P10071 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI3P10071 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI3P10071 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI3P10071 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLI3P10071 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLI3P10071 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI3P10071 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI3P10071 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI3P10071 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI3P10071 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI3P10071 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI3P10071 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI3P10071 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI3P10071 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI3P10071 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI3P10071 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI3P10071 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI3P10071 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI3P10071 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI3P10071 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI3P10071 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLI3P10071 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI3P10071 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI3P10071 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI3P10071 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI3P10071 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI3P10071 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI3P10071 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI3P10071 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI3P10071 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI3P10071 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI3P10071 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI3P10071 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI3P10071 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI3P10071 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI3P10071 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI3P10071 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI3P10071 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI3P10071 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLI3P10071 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms