Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK1P06493 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms