Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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