Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD2O96028 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD2O96028 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD2O96028 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD2O96028 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD2O96028 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD2O96028 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD2O96028 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD2O96028 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD2O96028 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD2O96028 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD2O96028 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD2O96028 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD2O96028 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD2O96028 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD2O96028 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD2O96028 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD2O96028 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD2O96028 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD2O96028 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD2O96028 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD2O96028 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD2O96028 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD2O96028 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD2O96028 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD2O96028 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD2O96028 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD2O96028 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD2O96028 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD2O96028 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD2O96028 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD2O96028 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD2O96028 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD2O96028 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NSD2O96028 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NSD2O96028 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NSD2O96028 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NSD2O96028 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NSD2O96028 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NSD2O96028 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NSD2O96028 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NSD2O96028 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NSD2O96028 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NSD2O96028 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NSD2O96028 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NSD2O96028 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD2O96028 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD2O96028 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD2O96028 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD2O96028 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD2O96028 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD2O96028 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD2O96028 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD2O96028 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD2O96028 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD2O96028 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD2O96028 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD2O96028 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD2O96028 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSD2O96028 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD2O96028 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD2O96028 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD2O96028 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD2O96028 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD2O96028 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms