Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX4O95219 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX4O95219 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNX4O95219 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNX4O95219 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNX4O95219 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNX4O95219 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX4O95219 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms