Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ZNF253O75346 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ZNF253O75346 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ZNF253O75346 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ZNF253O75346 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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ZNF253O75346 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF253O75346 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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