Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN1O60240 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms