Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRTO14522 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRTO14522 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
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