Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms