Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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