Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4E171 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4E171 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms