Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms