Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms