Protein–RNA interactions for Protein: A6NHL2

TUBAL3, Tubulin alpha chain-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBAL3A6NHL2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBAL3A6NHL2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms