Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HELTA6NFD8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms