Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA6A0AVT1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms