Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KLF12Q9Y4X4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms