Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRG3Q9Y2Y8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms