Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms