Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms