Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MKLN1Q9UL63 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms