Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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