Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCN3Q9P1Z3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms