Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms