Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSD3Q9NYI0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms