Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC10Q9NYD6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC10Q9NYD6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC10Q9NYD6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC10Q9NYD6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC10Q9NYD6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC10Q9NYD6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC10Q9NYD6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms