Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK1Q9NYA1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPHK1Q9NYA1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPHK1Q9NYA1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPHK1Q9NYA1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK1Q9NYA1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK1Q9NYA1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK1Q9NYA1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK1Q9NYA1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK1Q9NYA1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK1Q9NYA1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK1Q9NYA1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK1Q9NYA1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK1Q9NYA1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK1Q9NYA1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK1Q9NYA1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK1Q9NYA1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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