Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms