Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms