Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms