Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms