Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REEP4Q9H6H4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms