Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRXQ9BXM0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms