Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms