Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms