Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms