Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms