Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms