Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms