Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms