Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MYCBPQ99417 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MYCBPQ99417 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MYCBPQ99417 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MYCBPQ99417 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms