Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NSMCE2Q96MF7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms