Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP53Q96M91 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms