Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms