Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms