Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms