Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms