Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 DDX11L9-201ENST00000559159 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 HJURP-202ENST00000411486 3187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 ATP2A3-203ENST00000359983 3290 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 LINC01551-201ENST00000399387 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 TSPEAR-203ENST00000613245 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 LINC02250-201ENST00000422117 2491 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 ATF3-206ENST00000366987 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 CEACAM5-201ENST00000221992 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 NUTM2A-AS1-205ENST00000420424 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 GGCX-205ENST00000430215 2314 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 APBA2-202ENST00000411764 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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SVIPQ8NHG7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 STIM1-218ENST00000533977 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 VSIG1-201ENST00000217957 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SVIPQ8NHG7 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SVIPQ8NHG7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SVIPQ8NHG7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SVIPQ8NHG7 CPA6-201ENST00000297770 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SVIPQ8NHG7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SVIPQ8NHG7 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SVIPQ8NHG7 C14orf159-204ENST00000428926 2538 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SVIPQ8NHG7 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SVIPQ8NHG7 NDRG1-201ENST00000323851 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SVIPQ8NHG7 DGKZ-220ENST00000532868 3118 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SVIPQ8NHG7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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