Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms