Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP13Q86W25 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms